黑龙江省科学院前身是中国科学院黑龙江分院，始建于1958年，是省内在自然科学和技术科学方面最大的综合性研究和开发机构。

院直属单位有石油化学研究所、应用微生物研究所、技术物理研究所、自动化研究所、自然资源研究所、火山矿泉资源研究所、辐射化学试验中心、技术开发公司（哈尔滨龙科国际贸易公司）、科力公司、研究生部。院和直属研究所共有30多家科技企业。院代管单位有：国家地震局工程力学研究所、中国科学院黑龙江农业现代化研究所。挂靠院的学会有：省化学学会、省生物工程学会、省应用微生物学会、省自动化学会、省土地学会、省国土与经济研究会。这些学会分别编辑出版：《化学与粘合》、《生物技术》、《自动化技术与应用》、《国土与自然资源研究》、《新技术应用》等学术期刊。全院现有员工1673人，高级专业技术人员392人，中级专业技术人员586人，初级专业技术人员256人。专业技术人员中有工程院院士1人，国家级有突出贡献的专家9人，省级有突出贡献的专家7人。

黑龙江省科学院直属各所在高分子粘合剂、芳烃氧化、发酵工程、食用菌、辐射制备高分子材料、生产过程自动控制、核仪表、远距离遥测遥控遥讯、区域国土资源开发利用，寒带动植物等11个专业技术领域中的研究和开发在国内省内占优势，其中高分子胶粘剂的研究达到国际先进水平。国家地震局工程力学研究所是我国地震工程、防灾工程和工程振动方面研究的权威单位，在国际上享有盛名。中科院黑龙江农业现代化研究所的农业现代化综合技术的研究和应用在国内占优势。黑龙江省科学院的一个新的发展阶段已经开始！